根据欧洲多家航空业协会致欧盟委员会主席冯德莱恩的一封信函，4月全面启用的申根区出入境数字登记系统（EES）已在欧洲多国机场引发严重运营混乱。国际机场理事会欧洲分会（ACI Europe）、欧洲航空公司协会（Airlines 4 Europe）及国际航空运输协会（IATA）在信中描述，旅客在边境检查处排队长达五小时，部分航班因乘客无法及时登机而半空起飞。协会要求欧委会授权各机场在7月和8月“每当旅客量超过边境检查设施运营能力时”完全暂停生物识别检查，并在9月后建立一套可在“明确定义的例外情形”下启动的灵活机制。

航空业的紧急呼吁反映出新系统与暑期客流高峰之间的紧张关系。据《金融时报》报道，罗马机场管理公司负责人将系统崩溃风险评为“十分之八九”。此前，希腊已单方面暂停对英国旅客的生物识别检查至9月，法国警方5月也曾临时取消多佛港的额外检查。欧委会在4月与ACI Europe的会议中承认存在技术问题并称正在解决，但当时并未同意全面暂停EES登记。此次行业联合致信，正值欧洲机场预计7至8月客流量将比前两个月增加约4000万人次之际，协会警告若不采取行动，旅客将面临“显著恶化的困境”。

EES系统的推行是欧盟边境管理数字化战略的核心一环。该系统以指纹和面部扫描取代护照盖章，自动核验非欧盟公民的90天/180天停留期限，并与未来的欧洲旅行信息和授权系统（ETIAS）共同构成更严密的入境预检体系。根据欧盟日程，内政部长将于6月4日召开司法与内务理事会会议，评估申根区状况并确定2026-2027年优先事项，重点包括边境数字化、EES与ETIAS的实施以及移民与庇护公约的落地。北非媒体在相关分析中指出，新系统将使过往逾期停留、签证拒签记录及申报不一致等问题更容易被交叉比对，因此建议阿尔及利亚等国旅行者提交“无懈可击”的申请材料。这一判断同样适用于所有非欧盟旅客，包括日益增长的亚洲游客群体。

从全球视角看，EES引发的混乱正对欧洲作为旅游目的地的吸引力构成压力。意大利《快报》援引行业信函称，部分国际旅客已因担心边境长时间延误而放弃赴欧旅行，这可能冲击旅游业收入、航空连通性以及欧盟规则的可信度。对于中国等非欧盟国家旅客而言，新系统意味着入境申根区时需预留更长时间完成生物识别登记，且过往旅行记录的准确性将直接影响未来签证申请。目前，欧委会尚未对行业暂停请求作出正式回应，但6月内政部长会议预计将就边境管理的灵活性与安全性平衡展开讨论，而即将到来的暑期高峰将成为检验欧盟数字边境韧性的首个重大压力测试。